以上为众卿，政府之重臣。太常、光禄勋、卫尉，太仆、大理(廷尉)、大鸿胪、宗正、大司农、少府为汉之九卿，每卿皆有众多属官。蜀汉简政，卫尉以后七卿，其属官或多被删削，或文献失载，皆无考；从设置属官的情况看，蜀汉政府在九卿中特别重视太常、光禄勋。
        大长秋：一人，二千石。负责奉宣中宫之命；凡朝廷给赐皇室宗亲及宗亲当谒见皇帝者，具体办理有关通知，随中宫外出。许慈、来敏、梁虔曾任此职。 
        太子太傅：诸葛亮曾兼此职。
        侍中：比二千石。负责宾赞礼仪；皇帝外出时随从护驾，负玺陪乘，日常备帝切问近对，拾遗补阙。诸葛亮在《出师表》中曾说："侍中、侍郎郭攸之、费祎、董允等，此皆良实，志虑忠纯。愚以为宫中之事，事无大小，悉以咨之。"（《三国志》卷35《蜀书·诸葛亮传》）便反映了其职能。廖立、马良、郭演、关兴、郭悠之、费祎、宗预、诸葛瞻、董允、陈祗、樊建、张绍等人曾任此职。属官：中常侍，比二千石。负责侍卫皇帝左右，从帝入内宫，赞导宫内诸事、顾问应对。给事黄门侍郎，六百石。侍从皇帝左右，关通宫内外，与侍中一道出入内宫，近侍帷幄，省阅检查尚书上报的文书等。黄门丞，随帝出入。 
        录尚书事（或曰"平尚书事"）：无定员，公卿的加衔，无所不统。早在刘备任汉中王时，就设置了尚书台。章武元年，诸葛亮以丞相录尚书事，假节，总管军国大事，同样品级的司徒许靖无加衔，则很少过问政事，如同虚设。蒋琬、费祎先后以大将军录尚书事，皆总管军国大事。后因加强帝权的需要，此衔地位略降，镇南大将军马忠、卫将军诸葛瞻、辅国大将军董厥皆录尚书事，权虽较重，却无力总管军国之事。尚书令，一人，千石，负责选署及奏下尚书文书众事，总典纲纪，无所不统，其机构叫尚书台。皇帝出征时，尚书令率行台以随。日常事务，尚书令向有录尚书衔的上公请示，即有录尚书衔的上公直接管理尚书台。东汉以降，三公虚设，事归台阁，蜀汉体制亦承此风，有录尚书事衔的上公正是利用尚书台这个机构来控制朝廷，近而左右皇帝。法正、刘巴、李严、陈震、蒋琬、费祎、董允、吕义、陈祗、董厥、樊建等人先后曾担任过尚书令。尚书令品级虽不太高，但却控制着朝廷实权。尚书令地位之尊，可从刘备托孤时，丞相诸葛亮与尚书令李严共同受托，以及诸葛亮死后，先后执政的蒋琬、费祎皆前任尚书令等事中看清。属官：仆射，六百石，负责开封，掌授廪假钱谷，尚书令不在时，则奏下众事；尚书，五人，六百石夕或分曹主事．吏部负责选举，左民负责修缮功作飞盐池园苑，客曹负责处理外国夷狄之事，五兵负责中兵、外兵、骑兵、别兵、都民，度支专门负责军国支计。(蜀汉有选部郎，说明曾经分曹，但具体情况巳不太清楚)；郎中，四百石，负责文书起草；有吏部飞左选、右选，度支诸曹，其它或漏载，尚书主书令史。尚书郎中草稿后呈交尚书令审阅，通过后交令史重抄。
        中书令：一人，千石。与中书监共同负责枢密，可与尚书令-样奏事，又负责诏诰、诏草等事务。向充曾任此职。
        秘书令：一人，六百石，负责掌校秘书，或用其他官吏兼任此职。却正曾任此职。属官有秘书吏飞、令史、郎等。
        中领军、领军、前领军、行领军：负责皇帝的禁卫军。向宠曾由"典宿卫兵"的中部督升为中领军，有时也外出征战。吴班、冯习、龚衡曾为领军，张翼曾为前领军，赵统曾为行领军。属官：中护军、前护军、后护军、左护军、右护军各一人，负责皇帝的禁卫军，上朝时总统诸武将，负责武官选举诸事。屯骑校尉、步兵校尉、越骑校尉、长水校尉、射声校尉、各一人，皆比二千石，负责宿卫兵。蜀汉的后护军不见于记载、据秦汉官制既已置中、前、左、右护军，后护军也必置不疑，文献失载而已。
        御史中丞：一人，千石。在殿中负责图籍秘书等事。向条曾任此职。御史中丞在汉代本是御史大夫之丞，御史大夫转为司空(西汉末及东汉)后，留此职于宫中，蜀汉无御史大夫，此御史中丞之职能只是原御史大夫的很少的一部分。